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不依赖因子柔的终止，依赖柔因子的终止。
1、不依赖因子柔的终止：RNA聚合酶全酶在遇到终止子之前，转录出的RNA序列具有富含GC的发夹结构和在发夹结构后有6个尿嘧啶核苷酸连续排列的特点。具有特点的RNA被合成后，发夹结构形成，发夹结构后存在6个AU配对的DNA和RNA杂交链，维持AU配对是两个氢键，GC配对的3个氢键弱，使RNA从DNARNA杂交链上脱落下来，RNA的脱落就发出终止转录的信号，转录终止。
2、依赖柔因子的终止：有柔因子协助转录终止。柔因子具有ATP酶活性和RNADNA解旋酶活性，当柔因子与合成出的RNA结合后，执行解旋酶功能，通过水解ATP打开RNADNA杂交链，有利于转录终止。依赖柔因子的终止需要一种NusA蛋白质，能与辅助蛋白质结合，共同改变RNA聚合酶的构象，使其脱离模板。
不含有启动子.但是含有终止子序列.
启动子是一段结合RNA聚合酶的DNA区域,在它的下游开始转录成mRNA.把RNA开始转录的碱基位置叫+1的话,启动子就是在上游-10位置的6个碱基和-35区域的6个碱基,它们构成启动子的核心结构.而在更上游的地方有一些蛋白结合位点,目的是调控这个启动子的启动状况.总的来说,启动子自己在-10区上游,而+1区才开始转录.
终止子是在基因的下游终止转录的序列,它是可以被转录出来的.终止子分为两种,一种是需要rho因子的,一种是自己就能起作用的.工作原理是相似的,终止子那段RNA被转录出来之后,会因为自身配对形成一个小发夹一样的结构（茎-环结构）并带有一个尾巴.这个结构能占据（或者在rho因子的帮助下占据）RNA聚合酶本来要接着聚合下去的位置,并且用这个茎环结构去卡住聚合酶不让它继续下去.聚合酶被卡住了,转录就停止了.而RNA上会带有这一段序列.
上述是原核生物的原理,真核生物会在以上的基础上更复杂点.真核生物有RNA的成熟和修饰,所以还会对这些序列产生一些加工修改、
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